南京军区南京总医院麻醉科是全国最早建立麻醉专业的学科之一。自1947年即有专业麻醉医师，并于1964年正式建科。现有麻醉医师43名，其中主任医师3名﹑副主任医师9名﹑博士7名﹑硕士8名，拥有博士导师1名和硕士导师5名，学科为全国首家博士后科研工作站所在地，是南京大学、第二军医大学、徐州医学院和南方医科大学的研究生教学基地，是南京军区麻醉医学中心；并已建立了一支博士后导师﹑博士和硕士导师组成的学术领导群体，博士后﹑博士和硕士的组成的中坚人才梯队。曾任科室主任为李德馨教授和徐建国教授，现任主任为李伟彦教授、副主任为段满林教授和朱四海副教授。

科室下设中心手术室﹑重症监护室﹑疼痛诊疗中心和无痛内镜中心四个医疗中心，和专门的实验室。中心手术室拥有26个手术间，1间术前准备间；拥有第三代达芬奇手术机器人和杂交手术室。临床麻醉分为神经外科麻醉﹑心血管外科麻醉﹑普通外科麻醉﹑妇产科麻醉和骨科麻醉等亚学科。自2006年开始启用麻醉临床信息系统，手术过程中的所有医疗文书全部采用信息化管理。重症监护室分为术后恢复区和重症监护区，其中重症监护区成功救治了以抗非典女护士为代表的一大批多脏器功能衰竭的危重病人，年收容量大于两千人次。疼痛诊疗中心自2002年开设了疼痛门诊，2003年开始在麻醉病房收治疼痛病人。目前门诊已累计诊治门诊病人21300人次，住院病人800余人次，在国内疼痛治疗领域已有较高的声望。无痛内镜中心以无痛技术为纽带容纳了呼吸内科，消化内科，泌尿科，普通外科等检查科室，拥有九间普通镜检室，一间VIP镜检室，一间术后恢复室，使用全程智能化数字记录及管理系统。

近5年来，我科在国外发表SCI论文70余篇，国家统计源论文300余篇，撰写大型专业书籍18册。已获全国科技大会奖1项和全军科技大会项1项﹑湖北省科技进步一等奖1项、教育部高等学校优秀科研成果自然奖二等1项，军队科技进步二等奖3项。

学科目前的重点研究方向有：心肺脑复苏、疼痛生理和急性疼痛治疗、围手术期液体复苏的基础和临床研究、多器官功能不全综合症的病理生理和治疗对策。在未来几年将继续开展各种分子生物学方法，进行内啡肽、孤啡肽、NFκ-B和多种细胞因子等受体表达和受体克隆，将采用高效液相法、脑电双频谱和听觉诱发电位等研究麻醉药的群体动力学和设计计算机辅助的靶浓度给药。继续从气体小分子、亚细胞、细胞和大器官水平研究脑复苏措施及对兴奋性氨基酸、粘附因子、不再流现象等再灌注损伤的影响和细胞凋亡调控的机制，争取在理论和治疗效果上有较大进步。在疼痛治疗上将朝术后无痛、无应激方向发展，并广泛开展和组织全国多中心研究，形成新的学科增长点.